Clasamentul instituțiilor de învățământ conform National H-index este un clasament independent al productivității științifice și al activității de publicare a instituțiilor de învățământ.
| Organizație | Poziție | National H-index | H-index (Scopus) | H-index (WoS) | H-index (Google Scholar) | |
|---|---|---|---|---|---|---|
 | Universitatea de stat din Moldova | 1 | 76 | 68 | 97 | 126 |
 | Universitatea Tehnica A Moldovei | 2 | 68 | 78 | 77 | 99 |
 | Universitatea de Stat de Medicină și Farmacie "Nicolae Testimițeanu" din Republica Moldova | 3 | 59 | 63 | 57 | 111 |
 | Universitatea de Stat din Tiraspol | 4 | 14 | 14 | 13 | 29 |
 | Universitatea de Stat din Transnistria | 5 | 12 | 9 | 7 | 39 |
 | Universitatea de Stat din Comrat | 6 | 11 | 11 | 9 | 25 |
 | Universitatea Libera Internationala din Moldova | 7 | 9 | 8 | 7 | 23 |
 | Universitatea de Stat „Alecu Russo” din Bălţi | 7 | 9 | 7 | 6 | 27 |
 | Universitatea Pedagogică de Stat „Ion Creangă" din Chișinău | 8 | 8 | 3 | 8 | 26 |
 | Universitatea de Stat „Bogdan Petriceicu Hasdeu" din Cahul | 9 | 6 | 1 | 4 | 23 |
 | Universitatea Cooperatist-Comercială din Moldova | 10 | 2 | 1 | N/A | 8 |
 | Academia de Muzică, Teatru și Arte Plastice | 11 | 1 | N/A | N/A | 7 |
 | Universitatea de Studii Politice și Economice Europene "Constantin Stere" | 12 | 1 | 1 | N/A | 2 |